La Unidad Educativa Particular Javier se preocupa por ofrecer una formación integral a todos sus estudiantes. Por este motivo, la Pastoral le dedica especial atención a la preparación sacramental de niños y jóvenes. Los niños de Educación Básica Media participan de un cuidadoso proceso de formación para recibir a Jesús Eucaristía y así, alimentándose de su cuerpo y de sangre, vivir como sus pequeños discípulos.

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Los jóvenes de Bachillerato por su parte, participan activamente de un proceso de formación para recibir el sacramento de la Confirmación, un sacramento que los fortalece y los lanza a la vida para que sean testigos del amor, la reconciliación y el servicio. Así, llenos del Espíritu Santo, queremos que nuestros Javerianos y Javerianas, sean profetas que aporten en la construcción de un mundo mejor.